Τα ιδρυματικά αποθετήρια δημιουργήθηκαν έχοντας ως στόχο να συλλέγουν, να διατηρούν και να διαθέτουν την επιστημονική παραγωγή του ακαδημαϊκού ιδρύματος. Αυτές οι τρεις λειτουργίες των ιδρυματικών αποθετηρίων βρίσκονται αρκετές φορές αντιμέτωπες με τους περιορισμούς των πνευματικών δικαιωμάτων. Σκοπός αυτής της εργασία ήταν να καταγράψει και να παρουσιάσει πώς οι ελληνικές ακαδημαϊκές βιβλιοθήκες, που διαθέτουν ιδρυματικά αποθετήρια, διαχειρίζονται τις προκλήσεις που τους θέτουν τα δικαιώματα πνευματικής ιδιοκτησίας. Τα αποτελέσματα της έρευνας έδειξαν ότι οι περισσότερες ακαδημαϊκές βιβλιοθήκες διαθέτουν ιδρυματικό αποθετήριο και προσφέρουν ελεύθερη πρόσβαση στο περιεχόμενό του. Όσον αφορά τον τομέα των πνευματικών δικαιωμάτων, από την έρευνα παρατηρούμε ότι τα ελληνικά ιδρυματικά αποθετήρια αντιμετωπίζουν προκλήσεις σχετικά με τα θέματα πνευματικής ιδιοκτησίας, τις οποίες όμως μοιράζονται ισόποσα με τους δημιουργούς που καταθέτουν στο αποθετήριο. Οι δημιουργοί έχουν την κύρια ευθύνη για την απόθεση της εργασίας τους στο αποθετήριο αλλά και για την εκκαθάριση των πνευματικών δικαιωμάτων. Το κυριότερο πρόβλημα που επισημαίνεται από τις βιβλιοθήκες αλλά και τους δημιουργούς είναι η αδυναμία κατανόησης των εννοιών της πνευματικής ιδιοκτησίας. Η επικοινωνία με μεταξύ των βιβλιοθηκών μπορεί να θέσει τις βάσεις για τη δημιουργία κοινής πολιτικής και αντιμετώπισης των προβλημάτων που προκύπτουν από τα δικαιώματα πνευματικής ιδιοκτησίας.