Το Κέντρο Μικρασιατικών Σπουδών ιδρύθηκε από την μουσικολόγο Μέλπω Λογοθέτη-Merlier με τη συμπαράσταση του συζύγου της ελληνιστή Octave Merlier, το 1930 ως Μουσικό Λαογραφικό Αρχείο αρχικά, και μετεξελίχθηκε διευρύνοντας το αντικείμενο των ερευνών του σε Αρχείο Μικρασιατικής Λαογραφίας, το οποίο το 1949 πήρε το όνομα και τη μορφή του σημερινού Κέντρου Μικρασιατικών Σπουδών. Από το 1962 είναι νομικό πρόσωπο ιδιωτικού δικαίου και έχει ως στόχο τη συλλογή και μελέτη στοιχείων για την ιστορία και τον πολιτισμό του Μικρασιατικού Ελληνισμού πριν από το 1922. Το Κέντρο Μικρασιατικών Σπουδών στεγάζεται σε ένα από τα ωραιότερα νεοκλασσικά κτίρια της Αθήνας, στην οδό Κυδαθηναίων 11-13, στην Πλάκα.